Schrodinger Suites 2018是计算化学的软件,拥有分子建模、药物设计等内容,优化图形界面,功能全免升级,大幅度提高效率。平台解锁很多限制功能,内置安卓文件!
Schrodinger Suites 2018亮点
一、Maestro图形界面
1、通过改进的属性树,轻松控制项目表中的显示属性
2、在收藏夹工具栏中编辑标题
3、交互调整环形构造
4、查找核心Maestro功能,例如作为任务工具中的Surface和Hydrogen Bond面板
5、支持Mac触控板手势,包括缩放和Z轴旋转
6、可选择禁用预测高亮显示
7、控制超出选定范围的网格范围计算PB静电表面的原子数
8、可选择指定原子标签的小数精度 - 包括几个新学院教程
二、FEP +
1、可选择指定界面中的自定义热区域。单独控制受体和配体原子。快速查看显示溶剂和复杂腿部的热原子
2、检查共价结合蛋白质
3、配体系统的边缘分析
4、报告配体健康评估中与水分子的空间冲突
5、将FEP +结果输出到Excel用于进一步分析的工作簿
6、将FEP +结果导入LiveDesign
7、添加到文档中的新学院教程
Schrodinger Suites 2018优势
分子动力学
改进的膜松弛协议
AutoQSAR
轻松构建和应用深度学习模式使用我们的基于TensorFlow的DeepChem集成。适用于对大型数据集进行建模,可处理数十万种化合物
工作流和流水线
1、包括最新版本的KNIME(v3.5)
2、New Bioisoster更换节点
3、Maestro中KNIME工作流程支持的新快速表单节点
4、抗体构建的新工作流程示例和序列转换器
5、改进了Windows上许多面板的响应速度
6、提高了2D渲染器的速度
Schrodinger Suites 2018功能
(一)高通量虚拟筛选:薛定谔软件的虚拟筛选功能在35个CPU的集群上每天可以筛选150万个化合物。提供一站式的设置界面,用户可以定义特定的性质,以便过滤掉不满足性质的化合物;所需模块:Glide, LigPrep, QikProp, Epik, Sitemap, Liaision;
(二)精确对接:针对虚拟筛选后的富集化合物库或者用户自己特定的化合物库,利用薛定谔软件提供的精确对接模式可以考虑以下两种真实环境,得到的精确度结果可以和实验的结果相匹配:
(1)配体小分子对蛋白活性位点结构的诱导(Induced Fit);所需模块:Glide, Prime, Liaison, Sitemap, Epik, MacroModel, LigPrep, QikProp;
(2)蛋白分子诱导配体分子电荷的极化(QPLD),所需模块:Glide, Liaison, Sitemap, Epik, MacroModel, Qsite, Ligprep, Jaguar, QikProp;
(三)药效团和3D-QSAR:薛定谔提供的药效团和3D-QSAR的解决方案,在没有受体信
息的情况下,科研人员可以用活性配体的信息进行新药设计;所需模块:Phase, Confgen, Ligprep, MacroModel, Strike;
(四)全新药物设计(de novo design):薛定谔软件提供的me-too和me-better药物设计解决方案,允许用户替换已知化合物的侧链或者母核;所需模块:CombiGlide, Glide, Ligprep, Qikprop;
(五)酶催化,金属酶研究(QM/MM方法):薛定谔软件提供的QM/MM方法可以考虑蛋白活性位点的化学反应。所需模块:Qsite, Jaguar;
(六)生物分子结构模拟:可以精确模建蛋白、核酸、多糖结构;所需模块Prime, MacroModel;
(七)ADME性质预测:应用于药理方面的研究;所需模块:QikProp;
(八)化学信息学:薛定谔软件的化学信息学解决方法提供以下专业算法:二元指纹向量聚类分析;相似性分析;层次聚类方法;化学过滤方法;多样性分析;sphere exclusion diversity;字结构搜索;独特的SMILES产生法;多元线性回归;偏最小二乘回归;主成份分析;主成份回归分析;神经网络算法;朴素贝叶斯分析算法;自组织特征映射法;所需模块:Canvas;
Schrodinger Suites 2018测评
Schrodinger Suites 2018完美激活,不限制功能使用!