Dnaman是一款生物应用软件,可以帮助从事生物学方面的朋友,这里分析核酸、蛋白质等内容,日常工作都可以在线使用,免费开源,大家随时安装哦!
Dnaman特色
1、DNA和蛋白质序列编辑。
2、DNA序列转化。
3、多序列比对,对齐编辑和分析。
4、系统树分析。
5、DNA或蛋白质序列的点阵比较。
6、DNA序列组装和编辑。
7、BLAST通过网络界面在Intranet / Internet Server上进行搜索。
8、序列和数据库中的增强型图案搜索。
9、SiRNA选择器。
10、限制分析。
Dnaman亮点
绘制序列图与出版品质。
限制模式预测。
电子克隆。
从限制片段重建限制图。
静音突变分析创建/破坏限制性位点。
导向不匹配以创建/破坏限制站点。
翻译和密码子使用分析。
蛋白质疏水性/亲水性分析。
蛋白质表征:等电点的序列组成和预测。
Dnaman功能
蛋白质二级结构预测。
反向翻译。
PCR和测序引物的设计。
表征DNA或引物序列的热力学性质。
分歧分析。
管理寡核苷酸,DNA和蛋白质数据库。
生成随机序列。
Dnaman说明
1、数据库管理
选择数据库|经理命令打开数据库管理器”对话框。
2、DNA和蛋白质数据库
该软件的数据库功能,允许用户组织DNA和蛋白质序列的不同科目。
3、编辑记录信息
有关特定记录的信息可以编辑。在序列列表框中,所有记录按字母顺序或记录顺序列出。每个记录名字的数量显示记录的记录号ID.用DNAMAN自动分配。因此,您可以为不同的记录使用相同的名称。
4、扫描序列的相似性
它扫描所有的序列记录在默认的数据库搜索当前序列的同源序列。如果默认数据库包含DNA序列,则默认序列必须是DNA序列。如果默认数据库包含蛋白质序列,则默认序列必须是蛋白质序列。DNAMAN将使用快速对准方法扫描数据库的序列相似性。您可以选择对结果的最终输出使用快速对齐或最佳对齐方式。
5、错配分析
错配分析的目的是找到所有可能的退火位点的DNA序列的引物在默认。此功能可用于PCR和DNA测序的引物选择。权重矩阵用来区分引物位置的重要性。由于引物在3’末端对目标DNA的匹配比PCR扩增的5末端更重要,所以更多的权重被赋予3’末端。为了提高PCR引物的特异性,应始终检查引物与靶DNA之间是否存在次级退火位点。
Dnaman测评
Dnaman是高度集成化的应用!